
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
的研究效果
研究探讨人士研究性学习近年来保鲜冷库时候变长至羊肉的洛氏硬性、持水、色彩、存在于铁含氧量、ROS、脂质过氧化的物、MDA、GSH和GPX4水平来分析评估肌群企业細胞的铁消亡情况下。结论凸显,保鲜冷库时候变长至后,羊肉的洛氏硬性在第8天和第6天可观回落;持水力量拉低;本色变深,得不到有光泽,鲜灰色变的暗灰色。另外,存在于铁、化学活化氧和MDA的含氧量可观增大,細胞凋亡率可观提升。 探索工人导入不一样冷库日期的肩部肌肤合格品管理的蛋清质,以后开展SDS-PAGE研究,蛋清质条带在不一样时间段分布图不规则且相近(图1a)。有文化差异 蛋清在不一样合格品管理中的表明时候,研究挖掘一个组合格品管理的中四位数类似于一个水准(图1b),介绍肩部肌肤合格品管理蛋清质都具有好的组内相近性和组间文化差异形。 血清质组学共检测出1996种血清质。以B0为照表组,淘汰B1、B2、B4和B6中的血清来差别表答定性定量分析,共检测到37七个DEPs。将火山图可视化效果,并基于FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两种标准定性定量分析DEP。报告单如下图下图1c-f下图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别检测出22、33、73和140个DEPs,在这当中别调涨6、11、32和815个,变动16、22、41和5两个。聚类分析方式评价指标了不一食品冷藏阶段中,全身全身肌肉聚集中血清质的表答,报告单表示全身全身肌肉血清表答差别跟着保存期限的增大而增大(图1g)。
图1| 差异冷冻箱耗时的肌样板血清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不一冷冻時间的腿部肌肉产品的样品性别差异核蛋白分享(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁突然死亡球蛋白肽的PRM降钙素原检测探讨(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 体系结构KEGG丰度差距表述蛋白质的铁意外死亡机制化(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物制品提供了TMT参考值蛋清质组学枝术服務,拜谱怪物已开发做完并保持了建立完善非常成熟的转录组学、蛋清组学、基础代谢组学甚至几组学合力企业产品枝术服務采集体系,欢迎致电咨询!
选取专著:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.