在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

科学研究结局

1、从光敏培養血细胞中截取DNA交连蛋清质

要剥离光热塑球核苷酸-DNA分手后复合物用来LC-MS具体数据分析，小说家设计一堆种性质发生变化纯化细则，可从DNA中去必须热塑球核苷酸，仅在影响时凭借单独上色体组相处生物富集DNA热塑球核苷酸。用TRIZOL拆分上色质并清理入狱获的非热塑球核血清酶，第二将其重复容解以做RNase助代谢。凭借超声清洗剪截所得税率球核苷酸热塑DNA的拆分物，在硫氰酸胍中烧开性质发生变化，并在二钝化硅离心式柱上激动洗滌以去必须热塑球核苷酸必定会做好。凭借核酸酶净化处理从DNA中挥发光热塑球核血清酶，并做胰球核血清酶酶助代谢用来LC-MS具体数据分析。该的方式命名为为球核苷酸热塑DNA拆分或XDNAX。

图1.血清质交连DNA领取或XDNAX流量图（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可之间使用DNA的核氨基酸图谱

将光热塑策略广泛应用于MCF7上皮细胞核，出现 了1,805种侯选人血清，中间1,191种会存在于3个或越来越多次多次中。60%的DNA互相意义组有核酸依照的GO参考文献标注，在较弱核酸依照参考文献标注的血清质中，比较大的贡献度发源核纤层血清，后者是参入脱色质安排和上皮细胞核分化的血清质（图2）。

图2 . 可会直接打交道 DNA 的核脂肪酸（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3汇报总结了DNA主动影响组所蕴含的血清质-DNA程序界面名词解释主要是指的核苷酸交连肽。这是指伴随（1）球状DNA搭配成分域、（2）DNA 搭配起居不规律区（IDR）和（3）伴随与另一血清质（举例子组血清搭配血清）、RNA（举例子剪接要素）或相脱离区室（举例子核仁血清）主动影响而以至于的室内环境临近。

图3 . 可一直接受 DNA的结构的域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、化学发光法細胞扰动其间与DNA依照的转录系数

雌的缴素感觉α（ESR1）驻放在胞质溶胶中，一直到面对其配体，晕人易位到肿瘤血細胞，在在那里它与基因组组中的独特区域性构建以激活码独特的转录步骤。将血清饥饿的MCF7肿瘤血細胞曝露于高摄入量雌的缴素（10 nM 17β-雌二醇）4五7分钟，与仿真操作的比对肿瘤血細胞十分这些的DNA能够 的功效组（图4A）。至少，雌的缴素敏感后DNA能够 的功效组中的ESR1扩大了30倍（图4B）。总的言之，在1,814个化学发光法的球高球蛋白-DNA能够 的功效中，约有9%界面显示出多于2倍的可观转化，并分析到与ESR1具备着能够 的功效的球球蛋白如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌的激素清理乳房增生癌神经元 DNA 彼此反应组的降钙素原检测非常（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

个人总结

理论调查流入dna组的核核蛋白酶酶质以理解它是该如何被读取数据并付诸生活实践的，一直以来都是教学科研工人有一个太久的追求幸福。dna组可及性重要以DNA为咨询中心的方面对其进行理论调查，因此，到近些年就要，上色质妇科凝胶中的哪方面核核蛋白酶酶质与DNA 有物理性互不用尚不看不清楚。运用零高度光热塑，可发现了DNA互不用组中的基本上都数核核蛋白酶酶质，XDNAX技術将算作核核蛋白酶酶质-DNA互不用理论调查的强悍的工具。

拜谱个人总结

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的淀粉酶质组学、突显组学、消化吸收组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

关联性学术论文：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.