草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿软件最喜欢见的病症之中。肾集体中CaOx硫化锌过过饱和的堆积会可以造成的肾小管受损细胞受损和凋亡，可以可以造成的肾结石的出现。短链脂肪堆积的酸由肠腔内水解酸化池大肠杆菌发醇营养健康植物纤维所产生，不仅仅在线条肠腔天然屏障中起着反应反应，另一方面在软件质量上也起着反应的关键反应。至少，丁酸是最多样化的短链脂肪堆积的酸，兼备免疫力抑制性和免疫力抑制性反应,本研究浅论浅论丁酸对CaOx肾结石的反应以至于潜在的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医疗机构泌尿产科吴忠硕士生导师、周子健研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教受、周子健博士研究生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物体与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网络上药剂学学精准服务，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

优秀文章名字大全：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 雇主企业单位：华山医院口腔科 研究方案项目：大鼠、HK-2神经元 分成小组数据：参考组（Con）、沙盘模型组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱提拱能力：网路临床药理学在线检测

思绪方法图

深入分析后果

探究人群1实现大鼠绘图，按照生物学生物化学完成指标和组织性方面的问题学脱色等探究机制看见丁酸是可以减低CaOx绘图大鼠肾CaOx晶状体的出现和挫伤，调节CaOx绘图大鼠的宫颈炎症挫伤和钝化东西的适度表达出。另外，丁酸还可遏制草酸诱导性的HK-2神经体细胞挫伤、钝化应激反应和神经体细胞凋亡。 为探究性丁酸形式和靶染色体网洛，研发人工从PubChem查看丁酸和丁酸酯的二维和三维立体形式（图1A）。来进行PharmMapper的sql语句和Uniprot的sql语句处里后共筛分出115个丁酸靶染色体供进步研究分折。将染色体全部导到STRING的sql语句，来进行PPI网洛研究分折。Cytoscape拿出了排名的前20的核心区靶染色体的仔细网洛图，分为CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这核心区染色体与网洛中的任何染色体均症状出肯定的涉及到性，说明怎么写这染色体有机会展现着协同工作的效应。GO和KEGG研究分折阐释了丁酸核心区染色体的涉及到前提条件和海洋生理学功能表（图1C）。核心区染色体具体与类固醇性缴素对答、脱色应激性性对答、活力性氧細胞对类固醇性缴素兴奋的体现包括对含酸性电化学有机物的体现相关的英文。上述情况指出，这核心区染色体具体参予了脱色应激性性和对活力性氧的海洋生物技术体现方式，是肾结石建立机制化中至关关键的前提条件，这表示丁酸有机会在肾结石中展现关键的效应。

图1| 丁酸的结构与靶人类基因互联网讲解(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一部科学探索丁酸对CaOx肾结石事实上切靶DNA，科研分享成员利用GEO信息库对GSE73680中稳定较与CaOx肾结石患有的DNA性别差异做好了科研分享。较组与CaOx结石患有的不错性性别差异表明出DNA（DEGs）产前筛查标准的为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个DNA再次发生不错转变 ，之中3379个（89.4%）DNA表明出上涨，404个（10.6%）DNA表明出降低（图2A）。对DEGs做好聚类分析算法分享，热图提示了前10个被选中DEGs的二维分层现象聚类分析算法显著特点（图2B）。接着随后，科研分享成员使用GeneCards信息库手动监定了370个可能与CaOx肾结石相应的DNA，重要词排名前20位的预測DNA及相应性评判长为2C右图。成了找寻到丁酸医治CaOx肾结石的重要靶点，科研分享成员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相应DNA清理赢得一个Venn图。终究，CYP2C9被敲定为丁酸影晌CaOx肾结石的因素靶点(图2D)。因此，科研分享成员还做好了丁酸与CYP2C9的原子交接，CYP2C9的3个核苷酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸双方反应，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在根据在线药理学学推测CYP2C9是丁酸反应CaOx肾结石的靶基因组后，研究探讨成员还凭借神经人体细胞实验室可确认了CYP2C9可降草酸诱导型的HK-2神经人体细胞的ROS横向、慢性炎症损坏和凋亡。

图2| 多半据库综合阐述估计CYP2C9是丁酸用途于CaOx肾结石的靶dna

探析导致

本研究方案前提知道了丁酸在离体和身体均能控制CaOx肾结石类别的防被氧化应激状态状态和慢性感染挫伤，随着能够 电脑网络数据药学学需求能够丁酸的影响CaOx肾结石的意向靶点——CYP2C9，第四能够 生殖细胞核实践认为CYP2C9在草酸盐诱导型的HK-2生殖细胞核ROS能力、慢性感染挫伤和凋亡。这样的知道了认为丁酸几率能够 控制CYP2C9来控制CaOx肾结石的防被氧化应激状态状态，减小慢性感染挫伤。一项流程中拜谱海洋生物学带来了电脑网络数据药学学技艺设备提供业务，不仅而且拜谱海洋生物学可改善较为成熟建全的dna组学、蛋白酶质组学、消化吸收组学等多个学护肤品及技艺设备提供业务，欢迎词呼叫咨询了解！ 参阅毕业论文：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.