
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化掩盖淀粉酶组学产品,实现1000+玄之又玄度遮盖位点查出,可靠逆转經典靶点,全方向位置生信了解解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“发现了”到“效验”全步骤流程服务项目,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、测试步奏
02、监测数据分析
03、经“点”再次出现
在实测值数据文件中,检测出个文献资料中报道怎么写的特色靶点举例衣康酸遮盖位点,如首位个被发掘的衣康酸共价遮盖蛋清KEAP1,再有糖酵解径路中的3个的要素酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,还有炎性小体形成蛋清NLRP3和血细胞挫裂全过程中的的要素蛋清RIPK3等,其质谱图如下所述图提示。
04、产品的特征
1.许多质控
餐饮业化特情人探头孵育、SDS-PAGE检侧、WB确认、模板有关的性剖析等各个位检侧,确保安全好项目然而正规性。2.高能力质谱设备工作平台
在Orbitrap Astral全新一带高判别质谱仪扶持下,满足衣康过酸绘制位点及血清鉴定费新角度,保驾护航有效探索新出现 。3.全注意事项一趟式精准服务
来源于拜谱生物工程完整的调查网站,可供应“细胞核塑造→测试探针孵育→WB检查测量→高妙度衣康酸性反应体现检查测量→專屬生信研究→目标位点PRM认证”全具体步骤功能,省时省功更先问。05、分折内部(部位)
06、用途放向
PART 2、资料分享图片
医学文献一
英文怎么说名称:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
中文字幕大标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
探讨的内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
文献综述二
国外英文小标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
中文版版头:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
钻研玩法:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、案例分享衍生物想法
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13兼有强大的底物依照本事,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱生物工程衣康过酸掩盖组评测统计资料中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康过酸表达(如下图所示图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱工作小结
算作TCA循坏中的前面细胞细胞分泌物,衣康酸调细胞细胞分泌、免疫细胞系统系统和宫颈炎症病变之間的相互之间能力,为的根治免疫细胞系统系统宫颈炎症病变性慢性病供应了混用的根治战略。衣康酸型式中的亲电性α,β-不达到饱和状态羧酸型式能对球核苷酸上的催化活性半胱氨酸残基通过烷基化表达(迈克尔加上作用),哪一全文翻译后表达被统称“衣康酸表达(itaconation)”,而能决定球核苷酸模块,自我调节免疫细胞系统系统回复和细胞细胞分泌路线,为许多种慢性病食用的药物研发管理供应新指导思想。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用呈现血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物中医学千万化学发光法靶向治疗基础代谢组(QMT1000)或能量转换新陈新陈代谢靶向疗法新陈新陈代谢组货品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
参看文献资料
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.